神學樓宿舍
為增強學生在群體生活中彼此學習和提供深入生命交流的機會，未婚神學生必須於神學樓宿舍住宿，已婚學生按實際情況入住家庭宿舍。神學樓每層皆設有小廚房及洗、乾衣設備；每個房間設有空調及上網設施。現時，神學樓提供：93個單身學生宿位、家庭宿舍單位、課室、會議室（附影音設備）、研討室、讀書室、乒乓球桌及小型籃球場。神學樓亦可供教會、機構、學校、團體等借用進行會議、夏令營、訓練課程及退修等活動。
本院正在逐步改善神學樓的設施，期望能為同學提供更完善的學習和群體生活的住宿環境。
聖堂暨容啟東校長紀念樓
崇拜生活對基督徒的信仰生活及神學教育非常重要；因此，於一九六七年策劃興建崇基學院神學樓時，已包括一座小聖堂，但因經費不足而擱置。初期神學生數目不多，故使用崇基禮拜堂靜室，其後在神學樓四樓由閱讀室改建的小聖堂舉行崇拜。由於學生人數增加，座位不敷應用，神學院在二〇〇三年起計劃興建一座新聖堂，以供神學生日常舉行崇拜及祈禱之用。
神學院聖堂暨容啟東校長紀念樓興建工程於二〇〇九年十一月動工，於二〇一一年十一月舉行感恩奉獻禮，該樓宇為紀念崇基學院任期最長（一九六〇至一九七五）之校長，亦為神學院首任校長（一九六三至一九六八）容啟東教授而命名，以懷緬容校長對本港高等教育、基督教大學、教會、崇基學院及神學院之貢獻。工程費用全數由捐款支持。
容啟東校長紀念樓的主要設施包括： 聖堂—容納三百五十人，為神學院於學期內定時舉行崇拜之場地。聖堂每天早上九時至下午五時開放予個人靜修；祈禱室—可容納九十人，除每週舉行祈禱會外，其餘時間開放予全時間神學生作個人祈禱靜修；活動室—為多用途活動場地，可容納一百人；檔案室，研討室及研究員房間；升降機樓和鐘樓—以升降機和橋連接容啟東校長紀念樓及神學樓，方便行動不便人士出入。升降機樓亦為鐘樓，樓頂掛有廿四個鐘的鐘琴，可由電腦控制，每天早上十時至晚上十時之間每小時報時，在特定時間自動奏出預設的聖詩，亦可即時彈奏。聖堂旁之草地，放置耶穌為門徒洗腳之雕塑，以樹立耶穌非以役人，乃役於人之榜樣，為師生所效法。聖堂、祈禱室及活動室可供教會、學校及社會服務團體等借用。